Es la ciudad más antigua de la región, fundada en 1883 a orillas del río Chimehuin. Creada por el Ejército argentino durante la Campaña al Desierto, debe su nombre a la batalla de Junín y el “de los Andes” nació para diferenciarla de otras ciudades que llevan esa identidad. Domina el acceso al circuito de los lagos Curruhué Chico y Grande, los lagos Epulafquén y Carilafquén hasta llegar a las Termas de Epulafquén en Lahuen Có. Desde este punto se puede seguir a Chile por el paso Carirriñe. También es la localidad más próxima al circuito de los lagos Huechulafquén y Paimún, accediendo a las proximidades de la ladera sur del Volcán Lanín dentro del Parque Nacional del mismo nombre. Además, desde Junín de los Andes se llega al área Trómen del Parque Nacional, hasta el lago homónimo y hasta el punto de partida de la ruta normal de ascenso al Volcán Lanín, ubicada en la ladera norte. Por el mismo camino que llega esta zona del Parque Nacional Lanín, se puede cruzar a Chile por el paso internacional Mamuil Malal o Trómen, para dirigirse a las ciudades trasandinas de Curarrehue, Pucón, Villarrica y Temuco.

Otro de los accesos que nace en Junín de los Andes es el que permite visitar la zona norte del Parque Nacional Lanín, donde se encuentran los lagos Guillén y Rucachoroy, y acceder al circuito Pehuenia, que enlaza los lagos Aluminé, Moquehue y Ñorquinco, en las proximidades del paso internacional Icalma. En el departamento Huiliches que tiene su cabecera en Junín de los Andes, es donde se encuentra el mayor número de comunidades Mapuche asentadas de toda la Pcia. del Neuquén.